Uzavření transakce komplikuje postoj Evropské komise. Její dozorčí orgán nad hospodářskou soutěží pokládá fúzi za konkurenčně škodlivou. Navíc by údajně vedla ke zvyšování cen letenek. EK si navíc minulý týden vyžádala, aby se Lufthansa vzdala některých výnosných linek, což kolínský letecký přepravce jednoznačně odmítl. Pokud Evropská unie svůj názor do konce měsíce nezmění, bude moci německá společnost svoji nabídku na odkup Austrian Airlines vzít zpět.
Náhradní řešení zatím neexistuje. Rakouská vláda totiž nehodlá do neprofitujících aerolinií vložit potřebnou miliardu eur sama.